Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf60A6NFR6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf60A6NFR6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C5orf60A6NFR6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf60A6NFR6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms