Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GMNCA6NCL1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GMNCA6NCL1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GMNCA6NCL1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GMNCA6NCL1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms