Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms