Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POTEFA5A3E0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POTEFA5A3E0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POTEFA5A3E0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
POTEFA5A3E0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms