Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LNP1A1A4G5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LNP1A1A4G5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LNP1A1A4G5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LNP1A1A4G5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms