Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms