Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
HECTD4Q9Y4D8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms