Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFT52Q9Y366 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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IFT52Q9Y366 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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IFT52Q9Y366 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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IFT52Q9Y366 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT52Q9Y366 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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