Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms