Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PDZRN3Q9UPQ7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDZRN3Q9UPQ7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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