Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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