Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL13Q9P2N7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms