Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HCN3Q9P1Z3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms