Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDP1Q9P0J1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms