Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
THUMPD1Q9NXG2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms