Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNTG1Q9NSN8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms