Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT84Q9NSB2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT84Q9NSB2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms