Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCD2Q9BXW9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCD2Q9BXW9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms