Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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