Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms