Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms