Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DCLRE1CQ96SD1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms