Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms