Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGF29Q96ES7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms