Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAF2Q96CS3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms