Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFHD2Q96C19 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms