Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRUQ92729 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms