Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APH1BQ8WW43 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms