Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA6DQ8NFY4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEMA6DQ8NFY4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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SEMA6DQ8NFY4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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