Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms