Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM99Q8N816 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms