Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NXPE1Q8N323 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NXPE1Q8N323 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms