Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATG4DQ86TL0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms