Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC80Q76M96 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms