Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms