Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCBE1Q6UXH8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms