Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms