Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms