Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM46CQ5VWP2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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