Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1Q5T2W1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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