Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SAPCD1Q5SSQ6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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