Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KHDC3LQ587J8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms