Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NBPF1Q3BBV0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms