Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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