Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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