Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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