Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNAB1Q14722 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNAB1Q14722 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms