Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SSPNQ14714 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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