Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMC1AQ14683 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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