Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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BECN1Q14457 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BECN1Q14457 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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